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对于不同的分选柱,铁珠之间的空间在250-500μm,是白细胞直径的10倍以上,细胞可以自由流穿,不会有挤压或黏着。分选柱填充有不同规格的铁珠,将磁场放大10000倍,因此只需要非常少量且“小身材”的磁珠标记,即可有效分选细胞。无柱式分选磁场极度低,只能通过大量磁珠或是微米级的“大块头”磁珠标记来弥补。